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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
10/03/2008 |
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Data da última atualização: |
14/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DINIZ, F. M.; IYENGAR, A.; LIMA, P. S. da C.; MACLEAN, N.; BENTZEN, P. |
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Afiliação: |
FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN; ARATI IYENGAR; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN; NORMAN MACLEAN; PAUL BENTZEN. |
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Título: |
Application of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The number of microsatellite loci and their allelic diversity contribute to increase accuracy and informativity of genetic estimates, however, the isolation of microsatellite loci is not only laborious but also quite expensive. We used (GATA)n and (GACA)n tetranucleotide probes and single- and double-enrichment hybridization to construct and screen a genomic library with an increased proportion of DNA fragments containing repeat motifs. Repeats were found using both types of hybridization but the double-enrichment procedure recovered sequences of which 100% contained (GATA)n and (GACA)n motifs. Microsatellite loci primers were then designed with an M13R-tail or CAG-tag to produce scorable PCR products with minimal stutter. The approach used in this study suggests that double-enrichment is a worthwhile strategy when isolating repeat motifs from eukaryotic genomes. Moreover, the use of tailed microsatellite primers provides increased resolution for compound microsatellite loci, with a significant decrease in costs. |
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Palavras-Chave: |
Banda polimórfica; double-enrichment; double-hybridization; Enriquecimento duplo; Hibridação dupla; Microssatélite; stutter bands; tailed microsatellite primer. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/65872/1/Application-21449.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 14 | |
| 3. |  | DINIZ, F. M.; IYENGAR, A.; LIMA, P. S. da C.; MACLEAN, N.; BENTZEN, P. Application of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping. Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 5. | | BRITTO, F. B.; DINIZ, F. M.; KOBAYASHI, A. K.; LIMA, P. S. C.; ARAÚJO, E. C. E.; BENTZEN, P. Caracterização da estrutura genética do pinhão manso (Jatropha curcas L.): isolamento de fragmentos de dna enriquecidos com sequências de microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 5.; CLÍNICA TECNOLÓGICA EM BIODIESEL, 2., 2008, Lavras. Biodiesel: tecnologia limpa. Revista de Resumos. Lavras: UFLA, 2008. p. 105| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 6. | | BRITTO, F. B.; DINIZ, F. M.; KOBAYASHI, A. K.; LIMA, P. S. C.; ARAÚJO, E. C. E.; BENTZEN, P. Caracterização da estrutura genética do pinhão manso (Jatropha curcas L.): isolamento de fragmentos de dna enriquecidos com sequências de microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 5.; CLÍNICA TECNOLÓGICA EM BIODIESEL, 2., 2008, Lavras. Biodiesel: tecnologia limpa. Anais... Lavras: UFLA, 2008. 8 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 7. | | SANTOS, M. F.; SOUZA, I. G. B.; GOMES, S. O.; SILVA, G. R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Isolation and characterization of microsatellite markers in the spiny lobster, Panulirus echinatus Smith, 1869 (Decapoda: Palinuridae) by Illumina MiSeq sequencing. Journal of Genetics, v. 97, Online resources, p. e25-e30, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 8. | | BRITTO, F. B.; SCHMIDT, A. J.; CARVALHO, A. M. F.; VASCONCELOS, C. C. M. P.; FARIAS, A. M.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Population connectivity and larval dispersal of the exploited mangrove crab Ucides cordatus along the Brazilian coast. PeerJ, v. 6, Article e4702, Apr. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 9. | | BRITTO, F. B.; SABÓIA, E. N.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; ROSADO-LAVIOLA, T. B.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Molecular markers for the assessment of genetic diversity in Jatropha curcas L. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA EM PINHÃO MANSO, 1., 2009, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia; São Paulo: ABPPM, 2009. Editores: Bruno Galveas Laviola, Sérgio Delmar dos Anjos e Silva, Júlio César Albrecht. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 10. | | SOUZA, I. G. B.; PATERSON, I.; McBRIDE, M. C.; SOUZA, B. A.; PEREIRA, F. M.; LOPES, M. T. R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Isolation and characterization of 23 microsatellite loci in the stingless bee Melipona subnitida using next-generation sequencing. Conservation Genetics Resources, v. 7, n. 1, p. 239-241, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 11. | | SILVA, G. R. da; SOUZA, I. G. de B.; PEREIRA, F. de M.; SOUZA, B. de A.; LOPES, M. T. do R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Genome-wide discovery and characterization of microsatellite markers from Melipona fasciculata (Hymenoptera: Apidae), cross-amplifi cation and a snapshot assessment of the genetic diversity in two stingless bee populations. European Journal of Entomology, v. 115, p. 614-619, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 12. | | RAPOSO, R. da S.; BRITTO, F. B.; SOUZA, I. G. de B; CARVALHO, A. M. F. de; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Development and use of novel microsatellite markers from double-enriched genomic libraries in Guatemalan Jatropha curcas. Biochemical Systematics and Ecology, v. 59, p. 168-173, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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| 13. | | GOMES, S. O.; SOUZA, I. G. B.; SANTOS, M. F.; SILVA, G. R.; ALBRECHT, M.; MCKINLEY, A. S.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Discovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda: Brachyura: Gecarcinidae). Journal of Crustacean Biology, v. 32, n. 2, p. 1-5, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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| 14. | | SILVA, G. R. da; SOUZA, I. G. de B.; PEREIRA, F. de M.; LOPES, M. T. do R.; SOUZA, B. de A.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Sequenciamento de nova geração no desenvolvimento de Marcadores Microssatélites Dinucleotideos para abelhas-sem-ferrão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016. p. 103.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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